Základní informace

Praktikum z počítačového modelování ve fyzice a chemii

KFY/PPMFC

0+2+0

3 kr.

zápočet

František Karlický

Časový plán

1. Úvod - organizace praktika, seznámení s hardware a software, základní seznámení s úlohami a příručkami a návody k nim.

2. – 12. Úlohy - řešení zadaných úloh.

13. Náhradní termín

Seznam úloh

1. Vizualizace řešení obyčejných diferenciálních rovnic a jejich soustav. (PDF)

2. Vizualizace a vyšetřování průběhu párových interakcí. (PDF, zdrojové kódy)

3. Vizualizace a vyšetřování průběhu trojčásticových interakcí. (PDF, zdrojové kódy)

4. Molekulární struktury a mezimolekulové interakce. (PDF, zdrojové kódy)

5. Vibrace vícečásticových soustav v harmonické aproximaci. (PDF)

6. Numerické řešení pohybových rovnic Verletovými metodami. (PDF)

7. Simulace metodou molekulární dynamiky. (PDF)

8. Testování generátorů pseudonáhodných čísel. (PDF)

9. Numerická integrace metodou „crude“ Monte Carlo. (PDF, zdrojové kódy)

10. Výpočet středních hodnot metodou Monte Carlo. (PDF, zdrojové kódy)

11. Simulace metodou Monte Carlo. (PDF, zdrojové kódy)

Doporučená literatura

návody k úlohám (viz odkazy na pdf soubory výše)

manuály k používanému software Origin, Mathematica Calculation Center, Fortran Compiler, MolDraw (stručné informace a odkazy též na www stránkách Laboratoře počítačového modelování v přírodních vědách)

I. Nezbeda, J. Kolafa, M. Kotrla, Úvod do počítačových simulací metodou molekulární dynamiky a Monte Carlo. Praha: Karolinum 1998.

M. M. Woolfson, G. J. Pert, An Introduction to Computer Simulation, Oxford: Oxford University Press 1999.

A. J. Stone, The Theory of Intermolecular Forces, Oxford: Clarendon Press 2002.

D. Landau, K. Binder, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics. Cambridge: Cambridge University Press 2000.

D. C. Rapaport, The Art of Molecular Dynamics Simulation. Cambridge: Cambridge University Press 2004.

Podmínky úspěšného zakončení kurzu

Podmínkou k udělení zápočtu je

průběžná příprava

proměření všech úloh a ke každému měření vypracování protokolu splňující požadavky vedoucího praktika

zpět

nahoru